党的十八大以来，习近平总书记对农村基层党建工作多次作出重要指示，贯穿其中的核心思想就是，无论农村经济社会结构如何变化，无论经济社会组织如何发育成长，农村基层党组织的领导地位不能动摇，战斗堡垒作用不能削弱。突出党的领导核心地位，是坚持党在农村领导地位的内在要求，是实现农村经济社会健康发展的根本保证，也是抓好农村基层党建之魂，必须牢牢把握、聚焦聚力，紧紧围绕这一主线，全面提升农村基层党建工作水平，为推动农村改革发展、促进农村经济社会进步，提供坚强保证和有力支撑。农村基层党组织建设的基本内容，主要包括以下几个方面：
1.加强党的思想政治建设，始终保持党的纯洁性、先进性。
中国共产党自成立以来，历经了革命、建设、改革三个不同的历史时期，根据不同历史时期的时代特点，始终重视自身的思想建设，不断努力以思想建设来推动党的整体建设。党在成立初期，就重视在农村建立党组织以及进行思想建设，在改革开放和社会主义现代化建设的进程中，更要大力加强农村基层党的思想建设，消除党内各种有害情绪，保持党员最佳的精神状态，增强战斗力、凝聚力和吸引力，保持党的纯洁性、先进性。
2.加强领导班子建设，建设一支适应形势需要的农村基层高素质干部队伍。
党领导的事业要取得胜利，不但必须有正确的理论和路线，还必须有一支能坚决贯彻执行党的理论和路线的高素质干部队伍。建设一支守信念、讲奉献、有本领、重品行的农村基层干部队伍，对做好农村工作至关重要。党的各级领导班子是干部队伍的核心，领导班子建设又是整个干部队伍建设的重点。农村基层党组织领导班子建设是农村基层党组织建设的关键，加强农村基层党的领导班子建设是农村经济社会发展的根本保障。要使一大批思想素质好、工作能力强、致富带头作用好的人选拔到干部队伍中，村级领导班子得到了进一步加强。
3.加强党员队伍建设，不断增强党的凝聚力和战斗力。
党员队伍建设关系到党的性质和党的面貌，关系到党的凝聚力和战斗力。加强党员队伍建设是加强党的执政能力的基础，也是党的基层组织建设的基础环节。农村党员是党联系农民群众的桥梁和纽带，是发展农村经济、推动农村社会全面进步的骨干力量，是社会主义新农村建设的生力军。农村党员担负着把群众组织起来、把党的各项方针政策和党组织的决策落到实处的重要职责，是基层党组织战斗力的源泉。特别在新时期，更要积极引导广大党员加强党性修养，提高政策执行力，发挥党员的先锋模范作用，为美丽乡村建设、脱贫攻坚做出更大贡献。
4.加强党的作风建设，提高党在农村的凝聚力和战斗力。
作风建设是党的建设的重要组成部分，党的作风直接关系到党的形象和战斗力。农村基层党组织直接面向广大农民群众，作风如何，关系到党在农民群众中的形象，关系到党的路线方针政策在农村的贯彻执行。农村基层组织和干部在贯彻执行党在农村的各项方针政策中起着重要的作用，农村干部作风的好坏，决定着党和政府对农业、农村和农民各项决策能否真正落到实处。中国共产党在长期奋斗的历史中，不断发展并创造了加强自身建设的丰富经验，形成了优良传统，其中很重要的就是不断加强党的作风建设。
5.加强制度建设，提高党在农村的执政能力和执政水平。
制度是大家共同遵守的行动准则，“一定要把思想建设、组织建设和作风建设有机结合起来，把制度建设贯串其中，既立足于做好经常性工作，又抓紧解决存在的突出问题”。在农村基层党组织管理制度上，应加强对农村流动党员的管理，健全农村党员权利保障机制，建立农村党员参与决策制度。
近年来农村基层党组织建设得到不断加强，乡村干部的思想政治素质和科学文化素质，进一步提高，工作方式和方法进一步改变，执政能力和执政水平明显增强，但也面临着许多新情况、新问题。
1.农村党员队伍先锋模范作用发挥不够到位。当前，农村党员队伍整体素质不高，普遍存在队伍老化、文化水平偏低、作用发挥不明显等问题。这种现状严重影响了农村党员队伍先锋模范作用的发挥。同时，随着市场经济的发展，党员队伍中思想发生了变化，一些党员思想境界不高不起作用，一些党员素质能力不强起不了作用，一些党员长期外出失去了作用，一些党员败坏了党风起了消极作用。这些都成为农村党员教育管理的难点问题。
2.党员教育治理方式滞后，效果不理想。一是开展活动少，活动方式单调。一些基层党组织对开展党建活动存在被动应付现象，开展党建活动的次数普遍较少。平常组织活动时除了开会就是学习，活动缺乏生动性、时效性，造成一些党员对参加组织活动缺乏主动性，组织生活的实际效果差。二是相当一部分总支部的下设党支部由于无阵地、无经费，无热心党建工作的负责人，开展党建活动不积极、不主动，党组织对党员凝聚力和吸引力下降。
3.村级班子关系不够协调。个别村级班子对村党支部和村委会的职责、作用的认识存在偏差，出现“两委”争权、独权、揽权、越权、搁权等现象，“两委”各吹各的号，各唱各的调，削弱了整体战斗力。个别村级领导班子民主集中制难落实，村内一些重大事项都由个人或少数几个人说了算，班子成员互相猜疑、不团结，难以形成合力。
4.机制体制尚未完善。近几年来，农村基础设施得到了较好的发展，新农村面貌得到了较大改变，农村基层党建工作也取得了不少突破，村级办公场所和办公条件有了较大改观，村级工作制度和村民议事规程也相继得到制订和完善，但是挂在嘴上，写在纸上，贴在墙上的情况依然存在，一个科学的机制，一个顶用的管理办法，没有得到较好的贯彻落实和施行，没有得到较好的监督执行，使得村级工作运行机制的民主化、规范化、科学化有了折扣，也滋生了一些干部腐败的现象和个人乱作为的行为，引发了一些人民群众内部矛盾，挫伤了一些干部群众的积极性，影响了党组织的凝聚力、号召力和战斗力。
针对目前农村基层党组织建设中存在的问题，应从强化教育治理、保持黨员队伍的先进性，拓宽发展党员渠道、提高农村党员质量，理顺领导管理体制、规范好村级工作运行机制，建立完善村级干部激励保障机制，激发村级党员干部干事创业的活力等多方面，改进和加强党的农村基层组织的工作方式。
农村基层党组织建设是我们党在农村领导和执政的重要基础，是党在农村全部工作的基础。只有不断解决农村基层党组织建设过程中遇到的问题，才能进一步推动农村基层党组织建设事业的发展，使党的执政地位进一步得到巩固。