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总结中国古代建筑构造的读物——《清式营造则例》。这本书的出版破解了古代工匠们的千年密码；二是以河北蓟县的唐代建筑独乐寺为开端，对华北、山西、河南及江浙的1823座古建筑做了实地测绘考察，并对故宫进行了全面的测绘，出版了《中国建筑参考图集》10集。林徽因协助丈夫梁思成做了大量的工作，逐渐使学社成为在中国和世界享有声誉的学术组织。
为了抢救掩埋荒野、即将被遗忘的珍贵古建筑，完成《中国建筑参考图集》的出版，林徽因和丈夫一起远赴穷乡僻壤、荒寺古庙，风餐露宿、不辞辛劳地实地考察、研究、整理。从1930年到1945年，梁思成和林徽因夫妇走遍了中国15个省，200多个县，考察测绘了古建筑物200余个，获得了许多远溯唐宋的发现，很多古建筑就是通过他们的考察得到了世人的认识并加以保护，像河北赵州石桥、山西的应县木塔、五台山佛光寺等。梁思成夫妇的工作为中国古代建筑研究奠定了坚实的科学基础。林徽因还写下了有关建筑方面的论文、序跋等二十几篇，部分篇什为其与梁思成合著。
1937年，抗日战争全面爆发。梁思成一家为避战火，先到了长沙，后来又辗转到了西南的昆明、重庆。因为政局动荡、物资匮乏，物价飞涨，梁家的生活渐渐陷入捉襟见肘、入不敷出的窘境，有时他们要靠朋友们的资助才能维持日常的家庭开支。难能可贵的是，林徽因在这样的环境下能够洗尽铅华，“在菜籽油灯的微光下，缝着孩子的布鞋，买便宜的粗食回家煮，过着我们父辈少年时期的粗简生活”。在一封1940年11月写给费正清夫妇的信中，林徽因曾描述了她的邻居哲学家金岳霖战时的生活：“可怜的老金每天早晨在城里有课，常常要在早上五点半从这个村子出发，而没来得及上课空袭又开始了，然后就得跟着一群人奔向另一个方向的另一座城门、另一座小山，直到下午五点半，再绕许多路走回这个村子，一整天没吃、没喝、没工作、没休息，什么都没有！这就是生活。”虽然，生活困苦不堪，但林徽因和梁思成仍不愿离开祖国，他们拒绝了美国大学的高薪聘请，选择留在祖国吃苦，为的就是能同祖国共历苦难。
抗战胜利后，林徽因全家回到北平。1948年年底，解放军包围了北平。梁思成夫妇想到古城无数百年建筑可能毁于战火，日夜不眠，寝食难安。1949年初的一天，两位解放军拿着一张北平军用地图突然来到梁思成家，他们要求梁思成夫妇用红笔圈出一切重要文物古跡的位置，以便被迫攻城时尽可能地予以保护。这一举动让梁思成夫妇十分感动，随即消除了对共产党的疑虑。他们立即编写了《全国文物古建筑目录》，这本书后来演变成《全国文物保护目录》。北平解放后，林徽因受聘为清华大学建筑系教授，担任《中国建筑史》课程并为研究生开设了《住宅概论》等专题课题。
新中国成立后，林徽因和梁思成焕发出前所未有的工作热情。梁思成创办了清华大学建筑系，夫妇二人共同执教于建筑系，为培养新中国早期的建筑人才作出了巨大的贡献。林徽因也迸发出前所未有的旺盛精力，不但出色地完成了所担负的工作和教学任务，而且还与梁思成合作写了《城市规划大纲》、《中国建筑发展的历史阶段》等学术论文。她为《新观察》等刊物撰写了介绍我国古建筑的通俗读物十余篇。1949年9月到1950年6月，林徽因参与了中华人民共和国国徽的设计。1950年，林徽因被任命為北京计划委员会委员，对首都城建总体规划提出了具有建设性的意见。1951年，她担任人民英雄纪念碑建筑委员会委员，承担为碑座设计纹饰和花圈浮雕图案的任务。1952年，她参加中南海怀仁堂的内部装修设计，还参加在北京召开的亚洲及太平洋区域和平会议。1953年，她当选为中国建筑学会第一届理事会理事，并担任《建筑学报》编委、中国建筑研究委员会委员。林徽因还十分关心传统手工业的复兴，为濒临停业的景泰蓝、烧瓷等传统工艺品设计了一批具有民族风格的新式图案，并亲自参加试制。
1953年5月，北京市开始酝酿拆除牌楼，对古建筑的大规模拆除开始在这个城市蔓延。梁思成因提倡以传统形式保护北京古城而多次遭到批判。目睹明清古城被野蛮拆毁，梁思成和林徽因夫妇抚砖痛哭，惋惜不已。时任北京市副市长的吴晗当时负责解释拆除工作。为了挽救四朝古都仅存的完整牌楼街不因政治因素毁于一旦，梁思成与吴晗发生了激烈的争论。不久，在文化部举办的文物界知名人士欧美同学聚餐会上，林徽因也与吴晗发生了一次面对面的冲突。她指着吴晗的鼻子大声谴责：“你们真把古董给拆了，将来要后悔的！即使再把它恢复起来，充其量也只是假古董！”同济大学教授陈从周回忆说：“她（指林徽因）指著吴晗的鼻子，大声谴责。虽然那时她肺病已重，喉音失嗓，然而在她的神情与气氛中，真是句句是深情。”
林徽因早年患有肺病，抗日战争期间，几年颠沛流离的流亡生活，使得她的病情不断加剧，最终恶化为肺结核。这种病在当年是不治之症。病痛的折磨让佳人愈发苍老、憔悴。萧乾在《才女林徽因》一书曾这样描述：“听说徽因得了很严重的肺病，还经常得卧床休息。”进入中年后的林徽因，身体上的不适让她时常流露出忧郁之情。即便如此，病榻上的她凭着常人难以想象的坚强意志通读了《二十四史》中有关建筑的部分，为撰写《中国建筑史》搜集资料。她协助丈夫梁思成完成了《中国建筑史》初稿和用英文撰写的《中国建筑史图录》稿。
在林徽因的建筑论著中，她总是将建筑学家的科学、严谨的精神和作家的浪漫、唯美的气质结合得恰到好处、浑然天成。她的学术论文和调查报告不仅有周严的科学内容，而且经常用诗一般的语言来描绘中国古建筑在艺术方面的特色与成就。读她的论著如同在读一篇美文，在获以知识的同时，享受愉悦的文字之美。
林徽因在从事建筑科学研究之余，也从事文学创作。1931年4月，她的第一首诗《谁爱这不息的变幻》以“徽音”为笔名，发表于《诗刊》第二期上。紧接着她又先后在《诗刊》、《新月》、《北斗》、《大公报》等刊物上发表了几十篇作品。这些作品中大部分是诗歌，也有散文、小说、戏剧和文学评论。她的诗作风格如人，不仅清丽温婉，而且韵律自然，深受文学界和广大读者的推崇。其中最具有代表的是诗作《你是人间四月天》。林徽因还经常参加北平文学界读诗会等活动。1936年，平津各大学及文化界发表《平津文化界对时局宣言》，向国民政府提出抗日救亡的八项要求，林徽因是文艺界的发起人之一。
1955年4月1日，病重的林徽因拒绝吃药，最终辞世。享年51岁。
多年后，林徽因的儿子梁从诫曾这样评价母亲：“在现代中国的文化界里，母亲也许可以算得上是一位多少带有一些‘文艺复兴色彩’的人，即把多方面的知识和才华——文学的和科学的、人文学科和工程技术的、东方的和西方的、古代的和现代的——汇集于一身，并且不限于通常人们所说的‘修养’。而是在许多领域都能达到一般专业者难以企及的高度。”
面对林徽因这样一个轻灵、温婉的女子，我们不忍再去纠缠她的婚姻，因为我们相信她是幸福的；我们也不忍再去探寻她的真爱，因为我们知道那一代人有着世俗无法理解的纯情；我们更不愿再去揣度她诗句中的隐忍，因为时空的交错已经无法让我们完全读懂才女内心的波澜。我们只能从那一张张蒙着时光灰色的影像中，渐渐地走近她，从她眉宇间不轻易流露出的喜悦与忧伤中，感知她的才情，她的洒脱，她的绝代风华！